R语言挖掘公共数据库（TCGA、GEO）发表文章
现场完成一篇文章的流程以及所有图表，
全程实战，全程讲解代码，全部是自己的文章
无限回放，建群完善更好的售后服务
2022年5月14-15日 （线上授课 互动性强）
【课程简介】
没有经费做课题，没有实验造图形？其实，聪明人必须学着绕过去，我们不需要经费，完全不需要实验。
用R语言挖掘公共数据，发表SCI文章
R语言是科研工作者必备技能。本次会议以一篇SCI全文复现为目的，不瞎学R，用R解决科学问题，用R去发现新的临床问题。
【学习目标】
根据自己的专业，找到课题、挖掘机制、锁定标记物
基金中呈现漂亮的图表和前期基础
掌握R语言处理GEO，TCGA数据的所有核心技能
科研绘图的所有技能
【课程特色】
全程实战，全程讲解代码，全部是自己的文章，重点讲解关键步骤，
更多的售后服务，更好的掌握所有技能。
最大胆、最全面、最深入人心地直达灵魂地讲解。
至少2个套路的全程实战，让你快速掌握数据挖掘套路。
现场完成一篇文章的流程以及所有图表。
【授课老师】
猴哥：武汉大学博士，副主任医师，讲师，发表SCI论文25篇，历任3家公司数据分析师，100篇meta分析数据分析经验，43场公益讲座授课基础，5年免费答疑的耐心和责任心。主持国家自然科学基金1项，主持省级课题3项、湖北陈孝平科技发展基金会肝胆胰恶性肿瘤研究基金1项、国家级大学生创新创业训练计划项目3项。
| 日期 | 主题 | 主要培训内容 |
| 第一天上午
8:30-11:30 |
R语言实战入门
R安装 Rstudio安装 3小时掌握R语言 |
菜鸟如何学习R 语言
R语言数据构成和流程控制 如何用好for循环和apply家族函数 如何转换为可以直接套用代码的数据（数据调整） 猴哥文章中的数据清洗和整理 R语言统计和作图简介 R语言无障碍安装和调用 R语言导入和导出 |
| 第一天下午
1:30-4:30 |
R语言模块化技能 | GEO数据库从下载、整理、分析、出图、涵义（清除无意义的数据，发表级的热图，最漂亮的火山图，GO分析，KEGG分析，共表达网络）、GEO数据便捷实用的GSEA分析，GEO芯片的探针的注释 |
| 第一天晚上
7:00-10:00 |
全代码实战猴哥芯片meta分析核心部分
11分的文章实例解析生信联合实验套路 Sun M. Integrated analysis identifies microRNA-195 as a suppressor of Hippo-YAP pathway in colorectal cancer. Journal of Hematology & Oncology. 2017. 10(1):79 (IF=11.059, PMID: 28356122) |
芯片数据的检索、下载、预处理
猴哥多个GEO芯片联合分析（芯片meta）简介和制作 GEO芯片的探针转化为基因名的N种方法 R语言数据框的调整（掌握tidyr和dplyr） GE）芯片的差异分析、GO、KEGG、GSEA等 学员练习 （线上指导、配给视频练习） |
| 第二天上午
8:30-11:30 |
全代码复现生存相关signature文章核心部分
（A prognostic 4-gene expression signature for patients with HER2-negative breast cancer receiving taxane and anthracycline-based chemotherapy，Oncotarget, 2017） |
GEO数据下载 TCGA数据下载
生存相关signature的筛选和降维(lasso模型和rubust模型等) 批量生存分析 单因素生存分析 多因素生存分析 全代码制图 全代码制表 发表级图表的排版 |
| 第二天下午
1:30-4:30 |
TCGA ceRNA文章发表和制作
Sun M. a comprehensive study based on weighted gene co-expression network analysis and competing endogenous RNA network. Breast Cancer Res Treat. (IF 3.626, PMID: 30715658) |
TCGA数据下载和数据库找课题
提取mRNA、IncRNA、MiRNA矩阵 ceRNA网络构建 批量生存分析、单因素、多因素、制表、制图 批量GO、KEGG 实战讲解猴哥例文 |
【课程设置】
【主办单位】
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【会议时间】
2022年5月14-15日
【注册费用】
注册费用：3200元/人
两班连报6000元/人（可与其他任何班一起报名）
可开会务、注册、检测、分析服务等发票