私人订制课堂：紧扣最新热点零基础到手握5+生信热点分文章
这是史无前例的实战课程，你收获的不只是2天的互动教学课程，
你收获的是课后1对1的指导和个人文章批改，是科研思维的洗礼。
一次报课，一篇文章、终生受益。
（2022年5月14日-15日线上授课）
【课程特色】
1.生信体系：零基础极速掌握覆盖生信核心知识点的生信思维体系，摆脱精通生信知识却零散无体系，不会串联成文的窘境；
2.写作体系：零写作基础直接学会最正确SCI写作思路和步骤，摆脱无穷尽的无用的写作套路；
3.R语言本质：零基础极速掌握R语言的思维体系和核心知识点，避免耽误巨额宝贵时间变成专业码农，忘记了也不会写生信文章。
4.现场实战：一边讲解每个知识点，一边串联成文，实战分析和写SCI，课程讲完，一篇5+的稿子也写完；
5.私人定制课堂：学员可以带问题来，提一个课程外的知识点，课程上老师带领同学一起学习。
【授课老师】
百川，百川科研公众号创建者(BaichuanMedi)，211/985大学教授，发表SCI文章50余篇，数家SCI杂志审稿人，资深职业写手，擅长SCI文章撰写与修稿，具有多年生信培训经验，学员反响热烈。本次将倾情奉献，从构文思路、到实操步骤、到写作指导、到投稿修稿，提供一站式指导，课程紧紧围绕差异分析、泛癌分析、多组学分析、多芯片联合分析、批量生存分析、信号通路的筛选、蛋白互作、免疫微环境、ceRNA网络、单细胞测序、实验关键基因的筛选、基因Signature的筛选、预测模型的建立、预测模型的评价、LASSO回归、Nomogram诺模图、ROC曲线、以及最新的热点（课上内容）等等进行抽吸剥茧的精讲，现场指导写作，课程结束当天能够写成自己的文章初稿。
【课程目标】
（1）没有课题时，自己找到课题；没有机制时，自己找到机制；
（2）让自己SCI文章或国自然项目内容更夯实，思路逻辑更完美；
（3）思路缺乏创新性，怎么办？老师给你最新的生信分析热点；
（4）掌握R语言的核心技能，掌握批量分析方法，掌握顶层计算机思维体系；
（5）掌握生信SCI写作思路和修稿思路，快速成稿一篇SCI文章，解决毕业就业晋级压力；
（6）掌握生信分析的独家套路（5个套路供你选择）；
【课程核心内容，包含但不限于】
（1）泛癌分析；(2)非肿瘤生信的实操流程（以心梗示例）（3）生信分析联合meta分析; (4) 免疫微环境；（5）ceRNA网络构建；（6）细胞焦亡的分析流程；（7）蛋白质相互作用网络;(7)预测模型的建立及评价；（8）Cytoscape软件精讲；（9）实验基因的寻找与生信验证；（10）单基因泛癌分析；（11）多组学分析；（12）多芯片联合分析；（13）实验信号通路的筛选；（14）基因Signature的构建；（15）生信预测模型的建立；（16）预测模型的评价；（17）Cox回归；（18）LASSO回归；（19）Nomogram诺模图（20）ROC曲线；（21）单细胞测序核心知识点；（22）单细胞测序数据的整理；（23）单细胞测序数据的质控；（24）降维分析；（25）聚类分析；（26）单细胞测序细胞亚群的区分；（27）单细胞测序数据的差异分析；（28）单细胞测序细胞群的注释；（29）新的细胞亚群的鉴定；（30）如何结合生信热点发前沿文章。
【课程安排】
| 日期 | 课程主要内容 |
| 第1天
8:30-11:30 |
R语言基础知识介绍；R语言读入及读出； R包的多种安装模式； R包及bioconductor资源的使用； R语言数据框的操作； R语言数据结构及循环控制（向量、因子、矩阵、数据库、列表、for循环、if控制）； DIY自己的人生第一个批量处理函数； R语言绘图原理及体系；R语言基本绘图和高级绘图精讲及实操；
GEO数据库介绍、下载、清洗和探针注释；TCGA数据的下载、清洗、不同类型数据的转换 |
| 第1天
1:30-5:00 |
多个GEO芯片联合分析的多种思路；
GEO芯片的probe探针的转化方法汇总 差异分析精讲（从表达矩阵的整理、归一化、标准化到差异分析、多组差异分析、配对差异分析） 差异基因的呈现（精美火山图、热图、PCA图、小提琴图） GEO数据的处理流程演示及学员实战（数据清洗、热图、火山图、GO分析、KEGG分析、共表达分析） R语言实现生存分析、功能注释（精美生存曲线图） GSEA讲解及结果解读（精美GSEA图） GSEA分析的全套流程讲解及结果的诠释（精美GSEA图） 两个基因相关性分析； 单基因生存分析 多基因生存分析 |
| 第2天
8:30-11:30 |
任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达分析； 同一癌症不同亚型和不同分期的表达分析； 单基因在多个正常组织中的表达分析； 单基因在多个癌组织中的表达分析； 单基因在多个癌和癌旁中的表达分析； 预后模型类思路和实操精讲：基因Signature的构建；生信预测模型的建立；预测模型的评价； Cox回归； LASSO回归； Nomogram诺模图；ROC曲线。 蛋白互作网络构建、cytoscape的实操使用，MCODE的实操； cytoHubba实操选取Hub genes(精美蛋白互作图) 多个GEO数据的分析思维及实操
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| 第2天
1:30-5:00 |
ceRNA的理论讲解 mRNA incRNA miRNA的获取。ceRNA网络构建，ceRNA网络的验证 ceRNA网络的展示（发表极分子网络）
免疫微环境的理论讲解，免疫浸润实操：自己测序样本中免疫浸润 细胞丰度的计算；单基因表达与免疫细胞的影响、单基因突变与免疫细胞的影响、单基因拷贝数对免疫细胞的影响，免疫浸润细胞与临床因素的关系 单基因泛癌分析、泛癌表达量分析、泛癌生存分析 泛癌基因突变 泛癌免疫分析； 多组学分析； 单细胞测序的分析思路及操作流程(单细胞测序核心知识点；单细胞测序数据的整理；单细胞测序数据的质控；降维分析；聚类分析；单细胞测序细胞亚群的区分；单细胞测序数据的差异分析；单细胞测序细胞群的注释；新的细胞亚群的鉴定) 生信的其他应用(怎么利用TCGA/GEO数据库中找课题?怎么利用TCGA/GEO挖掘下游机制？如何利用TCGA/GEO数据库申请国自然？如何利用TCGA/GEO数据库发表文章？) 最新热点的分析思路指导(如何结合生信热点发前沿文章) SCI文章模块化写作精讲和修稿策略，实例讲解：审稿人让补充实验，如何不做实验也能让审稿人满意。 实战环节：每个分析步骤的一步一步，“我在讲，你在做，不懂你就问”的DIY环节； |
【涉及的31个议题】
1，没有课题时，如何找课题、找线索、找机制？
2，后续细胞实验，如何精准找到下游作用通路或因子？
3，花钱测序回来的一堆结果，乱七八糟，怎么梳理、再分析成一篇SCI论文？
4，gene signature类文章的一些禁忌，哪些是评审专家特别看重，一票否决的点？
5，当下热门的免疫微环境是怎么回事，怎么利用自己的数据进行操作?
6，审稿人说只有生信分析，没有实验验证，怎么办？,
7, TCGA数据库中的数据，怎么下载，需要进行哪些数据清洗？
8，文章写好了，怎么选刊，避免踩雷？
9，WGCNA是什么东西，为什么是生信分析的神器？
10，生存分析有几种方案？怎么进行批量操作？
11，免疫浸润的计算方法有多少种，怎么多种方法批量分析？
12，目前有什么热点，怎么结合热点，发出不一样的生信文章？
13，单基因生信分析，能做到什么程度?
14，两个基因，能进行什么生信分析，产生多少结果用于SCI文章中？
15，一群基因，能进行什么生信分析，产生多少结果用于SCI文章中？
16，如何利用生信挖掘，没有试验前期，也能写课题中标书？
17，差异表达分析怎么做、配对样本怎么做，多组样本怎么做，小样本怎么做，大样本怎么做？
18，GSEA基因集富集分析，优点是什么，缺点是什么，怎么做？CNS的大牛文章中到底是怎么用GSEA的？怎么在文章或课题里利用GSEA加分？
19，ceRNA网络怎么构建? 对于mRNA，miRNA，lncRNA，cirRNA，我们应该做些什么？
20，GE0芯片数据，除了热图、火山图，还能做什么？
21，那么多GEO平台，如何以不变应万变的进行探针ID转换？
22，GEO多芯片数据，如何进行批次效应的处理？
23，ssGSEA算是批次效应的终结者吗？批次效应的终结者到底是什么？
24，如何对长链非编码RNA、假基因等一网打尽的注释？
25，单基因GSEA怎么做？有什么用途？跑出的结果怎么挑选和分析？
26，TCGA数据的正常和癌组织怎么分组，转移和未转移怎么分组，配对样本怎么挑选？
27，如何从TCGA数据中提取出lncRNA？
28，同一基因出现不同的分析结果，我该信谁？
29，做通路分析时，肺癌的数据聚类出肝癌的通路，这是怎么回事？
30，我想进一步学习，但害怕四处折腾踩雷，有什么避雷指南?
31，别人生信学3个月或学半年，我怎么学，才能后来居上，超过他们？
【主办单位】
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【培训时间】
2022年5月14日-15日
【注册费用】
注册费用：3200元/人
可开会务、注册、检测、分析服务等发票